Nat Genet： 生命癌症中病毒分布

比利时胃癌学术委员会 Peter Lichter 团队最近研究者冒险了人类胃癌中寄生虫的分布。月初《自然—遗传学》的网站刊发了这一成果。

作为泛癌仅有基因序列量化联盟的一部分，该资料库整理了 38 个类型的 2658 例胃癌样本的仅有基因序列和一部分基因表达仅有基因序列测序资料，研究者其他部门利用歧见的方法，结合了 3 个独立资料库用以有系统研究者潜在的寄生虫寄生虫。在 382 个基因序列和 68 个基因表达第一组资料集中都监测到了寄生虫依赖于。研究者发现，仅有的与涉及的寄生虫，如爱泼斯坦—巴尔寄生虫（EBV）、乙型肝炎寄生虫（HBV）和人瘤寄生虫（HPV）的检出率都很极高。

这项研究者揭示了头颈癌中 HPV 和驱动基因突变的显着排他性以及 HPV 与 APOBEC 突变基本特征的涉及性，这表明抗寄生虫防御能力增极高是宫颈癌、膀胱癌和头颈癌的某种程度。对于 HBV、HPV16、HPV18 和黏液涉及寄生虫 2，寄生虫结合与基因序列拷贝数的均匀分布变化有关。在 TERT 操纵子处的结合与端粒酶的极高表达有关，从而微小介导了该的退化过程。内源性逆基因表达寄生虫的极高表达与肾癌患儿较差的生存期有关。

独有出处：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.